В 1987 году перешел на работу в отдел народных коллективов филармонии. Еще до поступления в высшее учебное заведение Н.Бадрутдинов много и плодотворно работал в художественной самодеятельности. За время работы в филармонии он проявил себя как талантливый музыкант, обладающий прекрасными природными данными, владеющий спецификой татарского инструментального исполнительства (баян), имея большой стаж концертмейстерской работы. Его исполнению присущи музыкальность, тонкое чувство стиля. Он чуткий ансамблист и концертмейстер, хорошо знающий природу вокального исполнительства. С ним выступали ведущие мастера искусств республики – И.Шакиров, А.Авзалова, Х.Тимергалиева, Р.Ибрагимова, З.Шарифуллина, А.Валеев, З.Сунгатуллина, Х.Бигичев и другие. Н.Бадрутдинов проявляет большой интерес к музыкальному фольклору. Еще в период учебы в педагогическом институте он неоднократно принимал участие в фольклорных экспедициях. Им расшифровано около 30 песен сибирских татар. Он также обладает способностью к композиции. Им создано много обработок татарских народных песен для баяна, написаны песни на стихи татарских поэтов, а также инструментальные произведения для баяна, интересные аранжировки многих концертных программ, включающих в себя популярные народные песни и произведения татарских композиторов. Н.Бадрутдинов часто записывался на Республиканском радио и телевидении с ведущими солистами республики. Принимал активное участие во всех концертах, проводимых филармонией и республикой. В последние годы работал музыкальным руководителем в бригаде заслуженного артиста Татарстана А.Валеева.  С 2000 г. по настоящее время является редактором главной редакции музыкальных и литературных программ телеканала “Татарстан–Новый век”. Автор популярной телепередачи «Җырлыйк әле”.